Известно, что Евгения была римлянка и жила в Александрии. Ее отец, Филипп, был послан императором Коммодом в Египет. Евгения была образованной и красивой, многие юноши хотели жениться на ней, но она не хотела выходить замуж. После прочтения Посланий апостола Павла, она обратилась к христианству и решила стать монахиней. Она ушла в мужской монастырь, прихватив с собой двух рабов, Прота и Иакинфа. Там они приняли Святое Крещение и Епископ Элия благословил Евгению на святое служение.

Евгения обладала даром исцеления благодаря своим подвигам. Однажды к ней обратилась за помощью молодая вдова Мелания. Однако Мелания влюбилась в инока и, когда он отверг ее, она обвинила его в попытке насилия. Евгения была позывана на суд, где вынуждена была раскрыть свою тайну. Родные обрадовались, узнав, что она жива. Позже все они приняли Святое Крещение. Ее отец Филипп был смещен с поста после доноса язычников и стал епископом Александрийской церкви. Он был убит после того, как был ранен во время молитвы.

Евгения и ее мать Клавдия уехали в Рим, где Евгения протяжала свою монашескую жизнь. Она привела к Христу множество девушек, а Клавдия помогала вдовам. В то время император Галлиен начал гонения на христиан, и многие из них нашли убежище у Клавдии и Евгении. Юная римская императрица Василла услышала о христианах и Евгении и написала ей письмо. Евгения прислала своих друзей Проту и Иакинфа, которые проповедовали Василле и она приняла Святое Крещение. Затем Василла отказалась выйти замуж за своего жениха Помпея из-за его неприятия христианства, и за это ее казнили.

Прота и Иакинфа также были обезглавлены, а Евгению привели в храм, но храм рухнул, когда она вступила в него. Ее пытались утопить, но она осталась невредимой. Ее бросили в ров, где она пробыла 10 дней, и в конце концов была казнена мечом в день Рождества.

Клавдия также приобщилась к мученической смерти. Евгения предсказала ей о своей смерти.