Преподобная Васса (в миру Мария) была супругой священника Иоанна, известного под прозвищем «Шестник». Он служил в Юрьеве (ныне Тарту) и вместе со священником Исидором окормлял местных православных христиан.
В 1470 году, спасаясь от гонений со стороны немецких католиков, отец Иоанн с семьёй переселился в Псков. Узнав о мученической гибели своего друга Исидора, он удалился в пещеру, по преданию созданную самим Богом, расположенную у границы с Ливонией. Здесь он решил основать монастырь — духовную крепость Православия. Мария последовала за мужем и вместе с ним участвовала в трудах по устройству пещеры и сооружению подземного храма.
Вскоре Мария тяжело заболела. Перед смертью она приняла монашество с именем Васса и вскоре отошла ко Господу. Ее святость была явлена сразу же после смерти. Отец Иоанн и её духовник погребли преподобную в стене пещеры, но ночью гроб оказался поднят на поверхность «невидимою Божией силой». Полагая, что причиной стал неполный чин отпевания, они совершили отпевание повторно и вновь предали тело земле. Однако на следующее утро гроб снова оказался на поверхности. Это чудо было воспринято как знамение святости усопшей. Тогда гроб преподобной Вассы установили в пещере с левой стороны.
Потрясённый увиденным, Иоанн принял монашеский постриг с именем Иона. Он также окончил свою жизнь в построенной им церкви, и его мощи ныне почивают рядом с мощами преподобной Вассы и старца Марка в псковских пещерах.
